Op 9 november 1961 – hij was nog herstellende van zijn mysterieuze val uit een rijdende trein – kreeg Antoon Coolen een hartaanval. Hij overleed om 18.30 uur in het Sint Jozefziekenhuis in Eindhoven. Op 13 november werd hij begraven bij de oude Sint Willibrorduskerk, terwijl het carillon Wilt heden nu treden speelde. Zijn vrouw Gerda stierf drie jaar later.