Op 23 juli 1994 benoemde paus Johannes Paulus II Tiny Muskens tot negende bisschop van Breda, een bisdom dat bestaat uit Westelijk Noord-Brabant en Zeeland. Op 26 november werd hij door zijn voorganger Huub Ernst tot bisschop gewijd. Niet in Breda, maar in Bergen op Zoom, centraal gelegen in het bisdom. Als wapenspreuk koos Muskens Shalom (vrede).

Door zijn verblijf in het buitenland was Muskens in Nederland nog een grote onbekende, maar daar kwam snel verandering in. Hij profileerde zich als een vooruitstrevende bisschop, die streed tegen misstanden in de samenleving zoals armoede en vrouwenhandel en daarbij nadrukkelijk de media opzocht. Hij was voor afschaffing van het celibaat en zag condooms als geoorloofd middel tegen AIDS. Ook pleitte hij voor een grotere rol van vrijwilligers en vrouwen in de kerk en zocht toenadering tot andere geloven, zowel binnen het christendom als daarbuiten. Muskens bleek bovendien een doener. Zo werkte hij elke week als vrijwilliger in een tehuis voor verstandelijk beperkte bejaarden.