Anna werd in 1558 begraven in de grafkelders onder de Prinsenkapel, in de Grote of Onze-Lieve-Vrouwekerk in Breda. Ze was daarmee de laatste telg van het geslacht Van Oranje-Nassau die in Breda begraven werd. Haar naam is te lezen op de sluitsteen van de grafkelder in de Prinsenkapel.